Edward Elric
Il est particulièrement petit, mais il compense largement sa petite taille par ses talents d’alchimiste. Véritable petit génie, Edward est le plus jeune alchimiste d’Etat de toute l’histoire de l’Académie.Comme tous les alchimistes d’Etat, il reçoit un nom de code : Full Metal Alchemist, en raison de sa jambe et de son bras bioniques. Dans l’espoir de retrouver leurs corps d’origine, lui et son frère Alphonse voyagent ensemble à la recherche de la pierre philosophale
Alphonse Elric
Lors d’une expérience interdite, il s’est dématérialisé et son âme a trouvé abri dans une armure grâce à l’aide d’Edward. Il possède également des talents d’alchimiste. Mais contrairement à son aîné, il ne présente pas l’examen d’entrée à l’Académie Nationale d’Alchimie pour devenir un alchimiste d’Etat, ce qui lui permet de faire certaines choses interdites aux alchimistes d’Etat… Des deux frères, Alphonse est sans aucun doute le plus gentil et le plus attentionné. Et malgré les épreuves, il répond toujours présent pour sortir son frère téméraire d’inévitables ennuis…
Winry Rockbell
Winry est une amie d'enfance d'Edward et Alphonse. Tous deux médecins, ses parents s’étaient portés volontaires pour soigner les blessés lors de la guerre d'Ishvar. Ils portaient assistance à tout le monde, alliés et ennemis. C’est pourquoi le général Basque Grand ordonna leur assassinat. Sa passion est sans conteste la mécanique, et plus particulièrement les prothèses bioniques. D'ailleurs, elle assiste très souvent sa grand-mère et s'occupe régulièrement des prothèses d'Edward.
Pinako Rockbell
Pinako est la grand-mère maternelle de Winry. Elle est très petite, calme et fume la pipe. Elle n'apparaît pas très souvent dans la série car elle ne quitte jamais Resembool. Edward et Winry la respectent beaucoup. Elle n'aime pas les militaires, et encore moins les alchimistes d’Etat, ces derniers ayant assassiné sa fille Sarah et son beau-fils.
Roy Mustang
Roy Mustang est un alchimiste d’Etat connu sous le nom de l'Alchimiste de Feu. Les gants qu’il porte lui permet de produire du feu d’un claquement de doigts ! Lieutenant-colonel dans un premier temps, il passera très vite au rang de colonel.Dégoûté par les méthodes de l'armée, il compte bien les changer en agissant de l’intérieur. Il a participé à la guerre d'Ishvar lors de laquelle il reçut l’ordre de tuer un couple de médecins et il en garde de profonds remords. Lorsque Edward et Alphonse envoyèrent des lettres à toutes les connaissances de leur père, Mustang fut le seul à répondre à leur appel. C’est d’ailleurs lui qui poussa Edward à passer l’examen d’entrée de l’Académie Nationale d’Alchimie.
Alex Louis Armstrong
Alex Louis Armstrong est un colosse ! Les yeux bleus, une petite houppette blonde et une somptueuse moustache, il a en permanence quelques étoiles qui viennent orner son visage. C'est un Alchimiste d’Etat 100% pur muscles qui mêle la force à l'alchimie pour se défaire de ses adversaires. Très fier de l'héritage de la famille Armstrong, il n'hésite pas à s’en vanter. Il sera plus tard chargé de veiller sur Edward.
Riza Hawkeye
Hawkeye fait partie de la section du colonnel Roy Mustang. C'est une fille très sexy et surtout très douée pour manier le pistolet. De genre plutôt strict, elle a pour principale mission de surveiller les activités de Mustang.
Maes Hugues
Le Major Hugues est un excellent père de famille qui ne rate pas une occasion de montrer les photos de sa petite fille. Plein d’humour, il se montre toujours proche des gens et attire la sympathie de tous. Alors qu’il faisait des recherches sur les Homoncules, il fut assassiné par Envy car il en savait trop…
Scar
Originaire d’Ishvar, Scar est un combattant hors pair doté d’un bras super-puissant. Il hait littéralement les alchimistes car ceux-ci ont tué son frère. Une peau mate, des yeux rouges et une grande cicatrice sur le front constituent ses particularités physiques. Il prétend représenter Dieu et a pour mission de détruire les alchimistes ainsi que toutes leurs créations.
Lust
D’apparence très sexy, Lust est une manipulatrice et fait partie des Homoncules voulant s’emparer de la pierre philosophale. Même si Sloth dirige le groupe, elle n’hésite pas à prendre des initiatives et à donner des ordres. Quand Lust apparaît, Gluttony est souvent à ses côtés. Enfin, selon une rumeur, le frère de Scar pratiquait l’alchimie et aurait créé Lust en tentant de ressusciter sa petite amie…
Envy
Agé de plus de 130 ans, Envy est l’un des plus vieux Homoncules. Il a le pouvoir de prendre l’apparence de quiconque. Il ne se souvient d’ailleurs plus de sa forme d'origine et prend désormais une apparence androgyne, qui laisse à jamais planer le doute sur son sexe… Il recherche activement la pierre philosophale et voue une haine féroce à Edward. Selon certaines théories, le père d’Edward et Alphonse serait le créateur d’Envy …
Gluttony
Gluttony est un Homoncule secondaire qui suit Lust dans tous ses déplacements. Plutôt taciturne, il n’ouvre la bouche que pour manger ou parler de nourriture. Il est capable de manger tout et n’importe quoi. Sa salive est extrêmement acide et tétanise nombre de ses adversaire